Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
AlkP97793 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
AlkP97793 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
AlkP97793 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
AlkP97793 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
AlkP97793 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
AlkP97793 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
AlkP97793 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
AlkP97793 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
AlkP97793 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
AlkP97793 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
AlkP97793 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
AlkP97793 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
AlkP97793 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
AlkP97793 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
AlkP97793 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
AlkP97793 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
AlkP97793 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
AlkP97793 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
AlkP97793 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
AlkP97793 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
AlkP97793 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
AlkP97793 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
AlkP97793 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
AlkP97793 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
AlkP97793 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
AlkP97793 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
AlkP97793 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
AlkP97793 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
AlkP97793 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
AlkP97793 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
AlkP97793 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
AlkP97793 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
AlkP97793 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
AlkP97793 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
AlkP97793 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
AlkP97793 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
AlkP97793 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
AlkP97793 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
AlkP97793 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
AlkP97793 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
AlkP97793 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
AlkP97793 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
AlkP97793 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
AlkP97793 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
AlkP97793 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
AlkP97793 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
AlkP97793 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
AlkP97793 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
AlkP97793 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
AlkP97793 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
AlkP97793 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
AlkP97793 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
AlkP97793 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
AlkP97793 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
AlkP97793 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
AlkP97793 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
AlkP97793 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
AlkP97793 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
AlkP97793 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
AlkP97793 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
AlkP97793 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
AlkP97793 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
AlkP97793 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
AlkP97793 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
AlkP97793 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
AlkP97793 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
AlkP97793 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
AlkP97793 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
AlkP97793 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
AlkP97793 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
AlkP97793 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
AlkP97793 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
AlkP97793 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
AlkP97793 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
AlkP97793 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
AlkP97793 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
AlkP97793 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
AlkP97793 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
AlkP97793 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
AlkP97793 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
AlkP97793 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
AlkP97793 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
AlkP97793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
AlkP97793 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
AlkP97793 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
AlkP97793 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
AlkP97793 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
AlkP97793 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
AlkP97793 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
AlkP97793 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
AlkP97793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
AlkP97793 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
AlkP97793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
AlkP97793 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
AlkP97793 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
AlkP97793 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
AlkP97793 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
AlkP97793 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
AlkP97793 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms