Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc13P50207 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc13P50207 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc13P50207 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc13P50207 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc13P50207 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc13P50207 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc13P50207 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.1 ms