Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Myo1bP46735 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo1bP46735 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Myo1bP46735 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Myo1bP46735 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Myo1bP46735 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo1bP46735 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo1bP46735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo1bP46735 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo1bP46735 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo1bP46735 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myo1bP46735 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo1bP46735 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo1bP46735 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms