Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 ERG13YML126C 1476 nt12.25□□□□□ -0.45
PDR11P40550 CWC15YDR163W 528 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR11P40550 ABZ2YMR289W 1125 nt12.22□□□□□ -0.45
PDR11P40550 ADH3YMR083W 1128 nt12.2□□□□□ -0.46
PDR11P40550 FLX1YIL134W 936 nt12.2□□□□□ -0.46
PDR11P40550 PHB2YGR231C 933 nt12.19□□□□□ -0.46
PDR11P40550 ALG12YNR030W 1656 nt12.18□□□□□ -0.46
PDR11P40550 PBP1YGR178C 2169 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR11P40550 SWM1YDR260C 513 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR11P40550 OPI3YJR073C 621 nt12.15□□□□□ -0.46
PDR11P40550 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR11P40550 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR11P40550 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR11P40550 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.13□□□□□ -0.47
PDR11P40550 THP3YPR045C 1413 nt12.12□□□□□ -0.47
PDR11P40550 TGA1tA(UGC)A 73 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR11P40550 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR11P40550 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR11P40550 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR11P40550 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR11P40550 AIM1YAL046C 357 nt12.1□□□□□ -0.47
PDR11P40550 YAT1YAR035W 2064 nt12.1□□□□□ -0.47
PDR11P40550 NAR1YNL240C 1476 nt12.09□□□□□ -0.47
PDR11P40550 TPC1YGR096W 945 nt12.09□□□□□ -0.47
PDR11P40550 RRT8YOL048C 1029 nt12.09□□□□□ -0.47
PDR11P40550 SAC7YDR389W 1965 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR11P40550 TVP23YDR084C 600 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR11P40550 MOB1YIL106W 945 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR11P40550 ENO2YHR174W 1314 nt12.06□□□□□ -0.48
PDR11P40550 VPS62YGR141W 1404 nt12.01□□□□□ -0.49
PDR11P40550 SER2YGR208W 930 nt12.01□□□□□ -0.49
PDR11P40550 CYT2YKL087C 675 nt12□□□□□ -0.49
PDR11P40550 FCY1YPR062W 477 nt12□□□□□ -0.49
PDR11P40550 YOR325WYOR325W 474 nt11.98□□□□□ -0.49
PDR11P40550 MCH5YOR306C 1566 nt11.97□□□□□ -0.49
PDR11P40550 ELO1YJL196C 933 nt11.97□□□□□ -0.49
PDR11P40550 YKR012CYKR012C 378 nt11.97□□□□□ -0.49
PDR11P40550 RPL12BYDR418W 498 nt11.96□□□□□ -0.49
PDR11P40550 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.96□□□□□ -0.5
PDR11P40550 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.96□□□□□ -0.5
PDR11P40550 AMF1YOR378W 1548 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR11P40550 YNR064CYNR064C 873 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR11P40550 YOR343CYOR343C 327 nt11.93□□□□□ -0.5
PDR11P40550 NAM8YHR086W 1572 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR11P40550 PCP1YGR101W 1041 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR11P40550 BET2YPR176C 978 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR11P40550 DIG1YPL049C 1359 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR11P40550 YDL086WYDL086W 822 nt11.9□□□□□ -0.5
PDR11P40550 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.9□□□□□ -0.5
PDR11P40550 MFG1YDL233W 1377 nt11.9□□□□□ -0.5
PDR11P40550 YMR007WYMR007W 381 nt11.89□□□□□ -0.51
PDR11P40550 FSH2YMR222C 672 nt11.88□□□□□ -0.51
PDR11P40550 CCT2YIL142W 1584 nt11.88□□□□□ -0.51
PDR11P40550 RPC82YPR190C 1965 nt11.87□□□□□ -0.51
PDR11P40550 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 YOR268CYOR268C 399 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 PAU21YOR394W 495 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 PAU22YPL282C 495 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 HTS1YPR033C 1641 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 TOS1YBR162C 1368 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 SDS24YBR214W 1584 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 CYC3YAL039C 810 nt11.86□□□□□ -0.51
PDR11P40550 SFL1YOR140W 2301 nt11.85□□□□□ -0.51
PDR11P40550 ERO1YML130C 1692 nt11.84□□□□□ -0.51
PDR11P40550 LSB6YJL100W 1824 nt11.82□□□□□ -0.52
PDR11P40550 YGR210CYGR210C 1236 nt11.82□□□□□ -0.52
PDR11P40550 ITR2YOL103W 1830 nt11.81□□□□□ -0.52
PDR11P40550 YLR280CYLR280C 351 nt11.81□□□□□ -0.52
PDR11P40550 SWT21YNL187W 1074 nt11.81□□□□□ -0.52
PDR11P40550 GRH1YDR517W 1119 nt11.8□□□□□ -0.52
PDR11P40550 YKL053WYKL053W 375 nt11.8□□□□□ -0.52
PDR11P40550 YLR046CYLR046C 813 nt11.8□□□□□ -0.52
PDR11P40550 HOG1YLR113W 1308 nt11.8□□□□□ -0.52
PDR11P40550 KAE1YKR038C 1161 nt11.79□□□□□ -0.52
PDR11P40550 LEU2YCL018W 1095 nt11.79□□□□□ -0.52
PDR11P40550 RCR1YBR005W 642 nt11.78□□□□□ -0.52
PDR11P40550 EMC3YKL207W 762 nt11.77□□□□□ -0.52
PDR11P40550 REX2YLR059C 810 nt11.77□□□□□ -0.52
PDR11P40550 VBA3YCL069W 1377 nt11.77□□□□□ -0.52
PDR11P40550 MET1YKR069W 1782 nt11.77□□□□□ -0.53
PDR11P40550 INA1YLR413W 2028 nt11.76□□□□□ -0.53
PDR11P40550 PET18YCR020C 648 nt11.75□□□□□ -0.53
PDR11P40550 SRP102YKL154W 735 nt11.75□□□□□ -0.53
PDR11P40550 OPI10YOL032W 741 nt11.75□□□□□ -0.53
PDR11P40550 HRA1HRA1 564 nt11.74□□□□□ -0.53
PDR11P40550 YJL160CYJL160C 864 nt11.74□□□□□ -0.53
PDR11P40550 ENO1YGR254W 1314 nt11.74□□□□□ -0.53
PDR11P40550 SUV3YPL029W 2214 nt11.71□□□□□ -0.53
PDR11P40550 LSR1LSR1 1175 nt11.69□□□□□ -0.54
PDR11P40550 ENT4YLL038C 744 nt11.69□□□□□ -0.54
PDR11P40550 YMR210WYMR210W 1350 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 DLD3YEL071W 1491 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 ILV3YJR016C 1758 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 UTR5YEL035C 501 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 YMR206WYMR206W 942 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 YPL108WYPL108W 507 nt11.68□□□□□ -0.54
PDR11P40550 KEL3YPL263C 1956 nt11.66□□□□□ -0.54
PDR11P40550 CRC1YOR100C 984 nt11.66□□□□□ -0.54
PDR11P40550 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt11.64□□□□□ -0.55
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