Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnc1O35914 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnc1O35914 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnc1O35914 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bnc1O35914 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnc1O35914 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bnc1O35914 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms