Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Bnc1O35914 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Bnc1O35914 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Bnc1O35914 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Bnc1O35914 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Bnc1O35914 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Bnc1O35914 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Bnc1O35914 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Bnc1O35914 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Bnc1O35914 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Bnc1O35914 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Bnc1O35914 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Bnc1O35914 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Bnc1O35914 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Bnc1O35914 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Bnc1O35914 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Bnc1O35914 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Bnc1O35914 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Bnc1O35914 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Bnc1O35914 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Bnc1O35914 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Bnc1O35914 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Bnc1O35914 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Bnc1O35914 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Bnc1O35914 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Bnc1O35914 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Bnc1O35914 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Bnc1O35914 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Bnc1O35914 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Bnc1O35914 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Bnc1O35914 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Bnc1O35914 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Bnc1O35914 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Bnc1O35914 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Bnc1O35914 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Bnc1O35914 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bnc1O35914 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Bnc1O35914 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Bnc1O35914 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bnc1O35914 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Bnc1O35914 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Bnc1O35914 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bnc1O35914 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bnc1O35914 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Bnc1O35914 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Bnc1O35914 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Bnc1O35914 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bnc1O35914 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bnc1O35914 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bnc1O35914 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bnc1O35914 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bnc1O35914 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bnc1O35914 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Bnc1O35914 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bnc1O35914 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bnc1O35914 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Bnc1O35914 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bnc1O35914 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bnc1O35914 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bnc1O35914 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Bnc1O35914 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bnc1O35914 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bnc1O35914 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Bnc1O35914 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bnc1O35914 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bnc1O35914 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bnc1O35914 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bnc1O35914 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bnc1O35914 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bnc1O35914 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bnc1O35914 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Bnc1O35914 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bnc1O35914 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bnc1O35914 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bnc1O35914 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bnc1O35914 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bnc1O35914 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bnc1O35914 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bnc1O35914 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bnc1O35914 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnc1O35914 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bnc1O35914 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bnc1O35914 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bnc1O35914 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bnc1O35914 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnc1O35914 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Bnc1O35914 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bnc1O35914 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bnc1O35914 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bnc1O35914 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bnc1O35914 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Bnc1O35914 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bnc1O35914 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bnc1O35914 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bnc1O35914 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bnc1O35914 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bnc1O35914 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bnc1O35914 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Bnc1O35914 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bnc1O35914 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms