Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trip12G5E870 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip12G5E870 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip12G5E870 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip12G5E870 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip12G5E870 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip12G5E870 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms