Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmpd4A2AFR3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd4A2AFR3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd4A2AFR3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd4A2AFR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd4A2AFR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd4A2AFR3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd4A2AFR3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd4A2AFR3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd4A2AFR3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd4A2AFR3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd4A2AFR3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd4A2AFR3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms