Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Prdm2A2A7B5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Prdm2A2A7B5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Prdm2A2A7B5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prdm2A2A7B5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prdm2A2A7B5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Prdm2A2A7B5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Prdm2A2A7B5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Prdm2A2A7B5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Prdm2A2A7B5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Prdm2A2A7B5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Prdm2A2A7B5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Prdm2A2A7B5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Prdm2A2A7B5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Prdm2A2A7B5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Prdm2A2A7B5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Prdm2A2A7B5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms