Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Arfgef2A2A5R2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Arfgef2A2A5R2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Arfgef2A2A5R2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Arfgef2A2A5R2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Arfgef2A2A5R2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Arfgef2A2A5R2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arfgef2A2A5R2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgef2A2A5R2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Arfgef2A2A5R2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Arfgef2A2A5R2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Arfgef2A2A5R2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms