Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms