Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms