Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC82Q8N4S0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms