Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeast

Predictions only

Length 921 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID28	P40547	YPP1	YGR198W	2454 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	SNF12	YNR023W	1701 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YOR392W	YOR392W	444 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YBR285W	YBR285W	435 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RSE1	YML049C	4086 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	TOM70	YNL121C	1854 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	ESL1	YIL151C	3357 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	TSA2	YDR453C	591 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	GLC7	YER133W	939 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RNR4	YGR180C	1038 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YKL066W	YKL066W	444 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RPL37A	YLR185W	267 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RPB11	YOL005C	363 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RNH70	YGR276C	1662 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	EXO84	YBR102C	2262 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	GYP7	YDL234C	2241 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	RPS22A	YJL190C	393 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YNL058C	YNL058C	951 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YOL134C	YOL134C	390 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	DGK1	YOR311C	873 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	TSC3	YBR058C-A	243 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	YPR014C	YPR014C	330 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	SIP3	YNL257C	3690 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	POM152	YMR129W	4014 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VID28	P40547	IRC4	YDR540C	540 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YGL165C	YGL165C	579 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	TEN1	YLR010C	483 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	SIP18	YMR175W	240 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	NSL1	YPL233W	651 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	RIX1	YHR197W	2292 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	DPB11	YJL090C	2295 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	MDM32	YOR147W	1869 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	AYT1	YLL063C	1425 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	ATG31	YDR022C	591 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	CRG1	YHR209W	876 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YJR023C	YJR023C	402 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YJR079W	YJR079W	330 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	PRE8	YML092C	753 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YNL043C	YNL043C	321 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	BOI1	YBL085W	2943 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	NPR1	YNL183C	2373 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	MED1	YPR070W	1701 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	SEN54	YPL083C	1404 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	ORC1	YML065W	2745 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YLR287C	YLR287C	1068 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	PEX17	YNL214W	600 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	VOA1	YGR106C	798 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YIL030W-A	YIL030W-A	339 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YKR033C	YKR033C	426 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	CDC33	YOL139C	642 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	SLM6	YBR266C	453 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	AXL1	YPR122W	3627 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	BNA4	YBL098W	1383 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	SRB8	YCR081W	4284 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	FUS1	YCL027W	1539 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	GPI19	YDR437W	423 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YMR31	YFR049W	372 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YHR214W-A	YHR214W-A	486 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	GPI14	YJR013W	1212 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YAR068W	YAR068W	486 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	PEP12	YOR036W	867 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	GPX2	YBR244W	489 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	COG3	YER157W	2406 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	TSC11	YER093C	4293 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	CDC20	YGL116W	1833 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	RRF1	YHR038W	693 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	ERP4	YOR016C	624 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	ROY1	YMR258C	1662 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	INP52	YNL106C	3552 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	PES4	YFR023W	1836 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YPL150W	YPL150W	2706 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	BSC3	YLR465C	309 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VID28	P40547	MOT1	YPL082C	5604 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	RPS17B	YDR447C	411 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	YER068C-A	YER068C-A	432 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	PNC1	YGL037C	651 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	YIL174W	YIL174W	228 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VID28	P40547	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		3.08	□□□□□ -1.92

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