Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8973D3YX71 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8973D3YX71 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8973D3YX71 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8973D3YX71 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8973D3YX71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms