Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms