Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3C1V9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3C1V9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3C1V9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q3C1V9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q3C1V9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Q3C1V9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q3C1V9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3C1V9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms