Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 SNA4YDL123W 423 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDR248CYDR248C 582 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 MIC19YFR011C 513 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YGR053CYGR053C 852 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PEF1YGR058W 1008 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YMR181CYMR181C 465 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 CBP6YBR120C 489 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YCL002CYCL002C 792 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ARK1YNL020C 1917 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PSD2YGR170W 3417 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ERT1YBR239C 1590 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 KEI1YDR367W 666 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 NTF2YER009W 378 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 EST3YIL009C-A 546 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YET1YKL065C 621 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 FPR1YNL135C 345 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 RPL33AYPL143W 324 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PHO2YDL106C 1680 nt2.78□□□□□ -1.96
BRF1P29056 APM3YBR288C 1452 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 ESC2YDR363W 1371 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YGR293CYGR293C 462 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 RNR2YJL026W 1200 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YML037CYML037C 1023 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 CRS5YOR031W 210 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 ISU1YPL135W 498 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YJL132WYJL132W 2253 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SDC25YLL016W 3147 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YIL080WYIL080W 4722 nt2.77□□□□□ -1.97
BRF1P29056 APC2YLR127C 2562 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 GYP7YDL234C 2241 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 ERG28YER044C 447 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YBR063CYBR063C 1215 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 VPS64YDR200C 1815 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SLP1YOR154W 1764 nt2.76□□□□□ -1.97
BRF1P29056 TCB2YNL087W 3537 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 RSM18YER050C 417 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YIP1YGR172C 747 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YIL012WYIL012W 342 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 ASG7YJL170C 630 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 RCN1YKL159C 636 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SDS22YKL193C 1017 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 CCW14YLR390W-A 717 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YRO2YBR054W 1035 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 KEL2YGR238C 2649 nt2.75□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SGS1YMR190C 4344 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YKR078WYKR078W 1758 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YIL174WYIL174W 228 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YJL147CYJL147C 1149 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YKR033CYKR033C 426 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 VPS63YLR261C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YBR051WYBR051W 351 nt2.74□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YDR338CYDR338C 2088 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YCL020WYCL020W 1317 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SHS1YDL225W 1656 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 TMA64YDR117C 1698 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 DNL4YOR005C 2835 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 PBP4YDL053C 558 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YOL107WYOL107W 1029 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 ATP3YBR039W 936 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YBR062CYBR062C 543 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 EDS1YBR033W 2760 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YCT1YLL055W 1596 nt2.73□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YCR099CYCR099C 468 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 MRP10YDL045W-A 288 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YGR050CYGR050C 357 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 SSP1YHR184W 1716 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 snR191snR191 274 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YNL018CYNL018C 1839 nt2.72□□□□□ -1.97
BRF1P29056 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 MND1YGL183C 660 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RRT16YNL105W 429 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 KTI11YBL071W-A 249 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RPL25YOL127W 429 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YPL276WYPL276W 438 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 ROY1YMR258C 1662 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 DNA2YHR164C 4569 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 SCY1YGL083W 2415 nt2.71□□□□□ -1.98
BRF1P29056 MRD1YPR112C 2664 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YHR078WYHR078W 1659 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 PCK1YKR097W 1650 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 UTP15YMR093W 1542 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YCR090CYCR090C 549 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YRB1YDR002W 606 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RPS22AYJL190C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 TMA10YLR327C 261 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RPS16AYMR143W 432 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 HEM4YOR278W 828 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YOR283WYOR283W 693 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YCL007CYCL007C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 UBP15YMR304W 3693 nt2.7□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YEF3YLR249W 3135 nt2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.9 ms