Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDKN3Q16667 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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