Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YBL044WYBL044W 369 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RHO2YNL090W 579 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 MGR1YCL044C 1254 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 CCT8YJL008C 1707 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 MCM3YEL032W 2916 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YEL1YBL060W 2064 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 GAD1YMR250W 1758 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YER158CYER158C 1722 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 PRK1YIL095W 2433 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YGR242WYGR242W 309 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 HSF1YGL073W 2502 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ICL1YER065C 1674 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 SKG3YLR187W 3081 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 KIN82YCR091W 2163 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ATO3YDR384C 828 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RPS8BYER102W 603 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RPS21BYJL136C 264 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RPS4AYJR145C 786 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ARO2YGL148W 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 VPS55YJR044C 423 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ATP22YDR350C 2055 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ACC1YNR016C 6702 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 LAS21YJL062W 2493 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 RPL35AYDL191W 363 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 FRQ1YDR373W 573 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YAE1YJR067C 426 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YBL053WYBL053W 375 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 AMD1YML035C 2433 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 MCM2YBL023C 2607 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 UBX7YBR273C 1311 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 COG8YML071C 1824 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 SNX41YDR425W 1878 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 VTC1YER072W 390 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YER187WYER187W 426 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YHR212CYHR212C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YAR060CYAR060C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 snR32snR32 188 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 HPF1YOL155C 2904 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 YJR030CYJR030C 2238 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 PTR3YFR029W 2037 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 COX1Q0045 1605 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 SKM1YOL113W 1968 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1A-BRQ12217 ELP2YGR200C 2367 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YHL042WYHL042W 453 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 URM1YIL008W 300 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 SSP120YLR250W 705 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 BIT2YBR270C 1638 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 DBP6YNR038W 1890 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YDR340WYDR340W 303 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 BAT1YHR208W 1182 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 RAD27YKL113C 1149 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 SAP30YMR263W 606 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YMR326CYMR326C 309 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YNL179CYNL179C 438 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 SAP155YFR040W 3009 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 ORC2YBR060C 1863 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 ATM1YMR301C 2073 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 APC5YOR249C 2058 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 IGO2YHR132W-A 396 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YIL102CYIL102C 306 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 STM1YLR150W 822 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YNL010WYNL010W 726 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PRM1YNL279W 1986 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PWP1YLR196W 1731 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 EXO70YJL085W 1872 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 UTP4YDR324C 2331 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 TAF7YMR227C 1773 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PIF1YML061C 2580 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PAU2YEL049W 363 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MRP8YKL142W 660 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YOR050CYOR050C 348 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 SGO1YOR073W 1773 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 RIM20YOR275C 1986 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 HTA1YDR225W 399 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YDR442WYDR442W 393 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 FMP10YER182W 735 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 OLI1Q0130 231 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YGR176WYGR176W 348 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YKL111CYKL111C 336 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 RPR1RPR1 369 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 AAD15YOL165C 432 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 NUT2YPR168W 474 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 FRE4YNR060W 2160 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 OCA5YHL029C 2040 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 LCB4YOR171C 1875 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YNR073CYNR073C 1509 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PDI1YCL043C 1569 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 PEX6YNL329C 3093 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MPS3YJL019W 2049 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MZM1YDR493W 372 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 RPL37AYLR185W 267 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YMR252CYMR252C 405 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MCP1YOR228C 909 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 NHA1YLR138W 2958 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 MCX1YBR227C 1563 nt4.91□□□□□ -1.62
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