Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INPP4AQ96PE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INPP4AQ96PE3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms