Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDKN3Q16667 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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