Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YJL086CYJL086C 369 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SDO1YLR022C 753 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 RIM11YMR139W 1113 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 GPI15YNL038W 690 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 RHO5YNL180C 996 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 MPD2YOL088C 834 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YBR051WYBR051W 351 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SVS1YPL163C 783 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 snR41snR41 95 nt3.68□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 DIT2YDR402C 1470 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 VAC14YLR386W 2643 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 HNT1YDL125C 477 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 ARF1YDL192W 546 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 NSA2YER126C 786 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SPT2YER161C 1002 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YKL044WYKL044W 321 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YKT6YKL196C 603 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YLR076CYLR076C 423 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 RIM9YMR063W 720 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 LDS2YOL047C 1071 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 LTP1YPR073C 486 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YGR237CYGR237C 2358 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YLR177WYLR177W 1887 nt3.67□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 DAL5YJR152W 1632 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YJR030CYJR030C 2238 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SRP68YPL243W 1800 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 RRN6YBL014C 2685 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SPT4YGR063C 309 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 MVB12YGR206W 306 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 LSM1YJL124C 519 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 CMS1YLR003C 876 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 PDP3YLR455W 915 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 LEE1YPL054W 906 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YJL132WYJL132W 2253 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 POL4YCR014C 1749 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 ARG2YJL071W 1725 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 RRP5YMR229C 5190 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 ADY4YLR227C 1482 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 ATG21YPL100W 1491 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 EXO5YBR163W 1758 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 SPT10YJL127C 1923 nt3.66□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 PWP2YCR057C 2772 nt3.65□□□□□ -1.82
VHS3Q08438 YDR537CYDR537C 606 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 LIF1YGL090W 1266 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YGR039WYGR039W 312 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SPO13YHR014W 876 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 CTK3YML112W 891 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RPL16BYNL069C 597 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 HHF1YBR009C 312 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ARG5,6YER069W 2592 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ZDS2YML109W 2829 nt3.65□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ALA1YOR335C 2877 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RIM13YMR154C 2184 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 FAP7YDL166C 594 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 FMN1YDR236C 657 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YDR431WYDR431W 312 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 IES5YER092W 378 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RPS8BYER102W 603 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YFR054CYFR054C 579 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 ECL1YGR146C 636 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YHL026CYHL026C 948 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SOD1YJR104C 465 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 COX19YLL018C-A 297 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 GTT2YLL060C 702 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 FLD1YLR404W 858 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SHH3YMR118C 591 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RPS8AYBL072C 603 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YOR331CYOR331C 558 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPR050CYPR050C 414 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SCY1YGL083W 2415 nt3.64□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 HRD1YOL013C 1656 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 IRC2YDR112W 309 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RSM24YDR175C 960 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SMT3YDR510W 306 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 GET1YGL020C 708 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YAP3YHL009C 993 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RPI1YIL119C 1224 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 DYN3YMR299C 939 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 TIR2YOR010C 756 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPR077CYPR077C 372 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 PMT6YGR199W 2280 nt3.63□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPS6YIR039C 1614 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 MUB1YMR100W 1863 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 KAR9YPL269W 1935 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 BYE1YKL005C 1785 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 KRI1YNL308C 1776 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 HUR1YGL168W 333 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 TMA19YKL056C 504 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 RAD14YMR201C 1116 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 CAT5YOR125C 702 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 YPR096CYPR096C 303 nt3.62□□□□□ -1.83
VHS3Q08438 SSE2YBR169C 2082 nt3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.6 ms