Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPC1P11940 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PABPC1P11940 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC1P11940 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC1P11940 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC1P11940 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC1P11940 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC1P11940 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC1P11940 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC1P11940 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms