Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D0

Mtmr9, Myotubularin-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr9Q9Z2D0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mtmr9Q9Z2D0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr9Q9Z2D0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr9Q9Z2D0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr9Q9Z2D0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr9Q9Z2D0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mtmr9Q9Z2D0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mtmr9Q9Z2D0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mtmr9Q9Z2D0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mtmr9Q9Z2D0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mtmr9Q9Z2D0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Mtmr9Q9Z2D0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mtmr9Q9Z2D0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms