Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scnn1bQ9WU38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scnn1bQ9WU38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scnn1bQ9WU38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scnn1bQ9WU38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scnn1bQ9WU38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scnn1bQ9WU38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scnn1bQ9WU38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scnn1bQ9WU38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scnn1bQ9WU38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scnn1bQ9WU38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scnn1bQ9WU38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms