Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpv2Q9WTR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpv2Q9WTR1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpv2Q9WTR1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpv2Q9WTR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpv2Q9WTR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpv2Q9WTR1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpv2Q9WTR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpv2Q9WTR1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpv2Q9WTR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpv2Q9WTR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpv2Q9WTR1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms