Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp11cQ9QZW0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp11cQ9QZW0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11cQ9QZW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp11cQ9QZW0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms