Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CtsmQ9JL96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsmQ9JL96 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsmQ9JL96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsmQ9JL96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsmQ9JL96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsmQ9JL96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms