Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacng3Q9JJV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacng3Q9JJV5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng3Q9JJV5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng3Q9JJV5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng3Q9JJV5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacng3Q9JJV5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacng3Q9JJV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms