Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp29Q9ES63 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp29Q9ES63 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp29Q9ES63 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp29Q9ES63 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp29Q9ES63 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp29Q9ES63 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp29Q9ES63 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp29Q9ES63 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp29Q9ES63 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp29Q9ES63 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp29Q9ES63 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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