Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H5

1700069L16Rik, RIKEN cDNA 1700069L16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700069L16RikQ9D9H5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700069L16RikQ9D9H5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700069L16RikQ9D9H5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700069L16RikQ9D9H5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700069L16RikQ9D9H5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700069L16RikQ9D9H5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700069L16RikQ9D9H5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700069L16RikQ9D9H5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700069L16RikQ9D9H5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700069L16RikQ9D9H5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
1700069L16RikQ9D9H5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700069L16RikQ9D9H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700069L16RikQ9D9H5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700069L16RikQ9D9H5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700069L16RikQ9D9H5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700069L16RikQ9D9H5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms