Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G2

Pebp4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pebp4Q9D9G2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pebp4Q9D9G2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pebp4Q9D9G2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms