Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam227bQ9D518 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam227bQ9D518 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam227bQ9D518 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam227bQ9D518 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam227bQ9D518 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam227bQ9D518 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227bQ9D518 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227bQ9D518 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam227bQ9D518 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms