Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc7Q9D0M0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc7Q9D0M0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc7Q9D0M0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc7Q9D0M0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Exosc7Q9D0M0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exosc7Q9D0M0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Exosc7Q9D0M0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms