Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt5Q9D0C4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt5Q9D0C4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt5Q9D0C4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt5Q9D0C4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt5Q9D0C4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt5Q9D0C4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms