Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp8Q9CY28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp8Q9CY28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp8Q9CY28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp8Q9CY28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp8Q9CY28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp8Q9CY28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp8Q9CY28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp8Q9CY28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms