Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrps28Q9CY16 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps28Q9CY16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrps28Q9CY16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps28Q9CY16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrps28Q9CY16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps28Q9CY16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrps28Q9CY16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrps28Q9CY16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrps28Q9CY16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrps28Q9CY16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrps28Q9CY16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms