Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp23Q9CX11 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp23Q9CX11 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp23Q9CX11 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp23Q9CX11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp23Q9CX11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms