Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
Sycp2Q9CUU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Sycp2Q9CUU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC47.98■■■■■ 5.27
Sycp2Q9CUU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Sycp2Q9CUU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC47.89■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Sycp2Q9CUU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC47.83■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Sycp2Q9CUU3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Sycp2Q9CUU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Sycp2Q9CUU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Sycp2Q9CUU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC47.76■■■■■ 5.24
Sycp2Q9CUU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Sycp2Q9CUU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Sycp2Q9CUU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Sycp2Q9CUU3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Sycp2Q9CUU3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Sycp2Q9CUU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Sycp2Q9CUU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Sycp2Q9CUU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Sycp2Q9CUU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Sycp2Q9CUU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.53■■■■■ 5.2
Sycp2Q9CUU3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Sycp2Q9CUU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Sycp2Q9CUU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Sycp2Q9CUU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
Sycp2Q9CUU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Sycp2Q9CUU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
Sycp2Q9CUU3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Sycp2Q9CUU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
Sycp2Q9CUU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
Sycp2Q9CUU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
Sycp2Q9CUU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
Sycp2Q9CUU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Sycp2Q9CUU3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Sycp2Q9CUU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Sycp2Q9CUU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Sycp2Q9CUU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC47.24■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Sycp2Q9CUU3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
Sycp2Q9CUU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
Sycp2Q9CUU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
Sycp2Q9CUU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Sycp2Q9CUU3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Sycp2Q9CUU3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms