Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930553M12RikQ9CUH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930553M12RikQ9CUH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930553M12RikQ9CUH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930553M12RikQ9CUH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930553M12RikQ9CUH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms