Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ferd3lQ923Z4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ferd3lQ923Z4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ferd3lQ923Z4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ferd3lQ923Z4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ferd3lQ923Z4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ferd3lQ923Z4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ferd3lQ923Z4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ferd3lQ923Z4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ferd3lQ923Z4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms