Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nlrp6Q91WS2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nlrp6Q91WS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nlrp6Q91WS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nlrp6Q91WS2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Nlrp6Q91WS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nlrp6Q91WS2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nlrp6Q91WS2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlrp6Q91WS2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nlrp6Q91WS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nlrp6Q91WS2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nlrp6Q91WS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nlrp6Q91WS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nlrp6Q91WS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms