Protein–RNA interactions for Protein: Q8VGL0

Olfr340, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr340Q8VGL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Olfr340Q8VGL0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Olfr340Q8VGL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Olfr340Q8VGL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Olfr340Q8VGL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Olfr340Q8VGL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Olfr340Q8VGL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Olfr340Q8VGL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Olfr340Q8VGL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Olfr340Q8VGL0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Olfr340Q8VGL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms