Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snap47Q8R570 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snap47Q8R570 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snap47Q8R570 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Snap47Q8R570 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snap47Q8R570 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap47Q8R570 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snap47Q8R570 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap47Q8R570 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Snap47Q8R570 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snap47Q8R570 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snap47Q8R570 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snap47Q8R570 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snap47Q8R570 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snap47Q8R570 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snap47Q8R570 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms