Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T0

Tmprss3, Transmembrane protease serine 3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss3Q8K1T0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmprss3Q8K1T0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmprss3Q8K1T0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmprss3Q8K1T0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmprss3Q8K1T0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmprss3Q8K1T0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmprss3Q8K1T0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss3Q8K1T0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmprss3Q8K1T0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss3Q8K1T0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss3Q8K1T0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.6 ms