Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RybpQ8CCI5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RybpQ8CCI5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RybpQ8CCI5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RybpQ8CCI5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RybpQ8CCI5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RybpQ8CCI5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RybpQ8CCI5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms