Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l2Q7TN88 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l2Q7TN88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l2Q7TN88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l2Q7TN88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l2Q7TN88 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd1l2Q7TN88 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd1l2Q7TN88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd1l2Q7TN88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l2Q7TN88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l2Q7TN88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd1l2Q7TN88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms