Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Pkd1l2Q7TN88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pkd1l2Q7TN88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pkd1l2Q7TN88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Pkd1l2Q7TN88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Pkd1l2Q7TN88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pkd1l2Q7TN88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pkd1l2Q7TN88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pkd1l2Q7TN88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Pkd1l2Q7TN88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd1l2Q7TN88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pkd1l2Q7TN88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pkd1l2Q7TN88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd1l2Q7TN88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd1l2Q7TN88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd1l2Q7TN88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd1l2Q7TN88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd1l2Q7TN88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pkd1l2Q7TN88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pkd1l2Q7TN88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd1l2Q7TN88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd1l2Q7TN88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd1l2Q7TN88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd1l2Q7TN88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkd1l2Q7TN88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkd1l2Q7TN88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkd1l2Q7TN88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd1l2Q7TN88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd1l2Q7TN88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pkd1l2Q7TN88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkd1l2Q7TN88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkd1l2Q7TN88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkd1l2Q7TN88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkd1l2Q7TN88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd1l2Q7TN88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd1l2Q7TN88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd1l2Q7TN88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd1l2Q7TN88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd1l2Q7TN88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd1l2Q7TN88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd1l2Q7TN88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd1l2Q7TN88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd1l2Q7TN88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkd1l2Q7TN88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkd1l2Q7TN88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkd1l2Q7TN88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd1l2Q7TN88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd1l2Q7TN88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd1l2Q7TN88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd1l2Q7TN88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd1l2Q7TN88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd1l2Q7TN88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd1l2Q7TN88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd1l2Q7TN88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd1l2Q7TN88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkd1l2Q7TN88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd1l2Q7TN88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkd1l2Q7TN88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd1l2Q7TN88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd1l2Q7TN88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd1l2Q7TN88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd1l2Q7TN88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd1l2Q7TN88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd1l2Q7TN88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd1l2Q7TN88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd1l2Q7TN88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd1l2Q7TN88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd1l2Q7TN88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd1l2Q7TN88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd1l2Q7TN88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd1l2Q7TN88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd1l2Q7TN88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd1l2Q7TN88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd1l2Q7TN88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd1l2Q7TN88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd1l2Q7TN88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd1l2Q7TN88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd1l2Q7TN88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd1l2Q7TN88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd1l2Q7TN88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd1l2Q7TN88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd1l2Q7TN88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd1l2Q7TN88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms