Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Rtl1Q7M732 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Rtl1Q7M732 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Rtl1Q7M732 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Rtl1Q7M732 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Rtl1Q7M732 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Rtl1Q7M732 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Rtl1Q7M732 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC45.19■■■■■ 4.83
Rtl1Q7M732 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Rtl1Q7M732 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Rtl1Q7M732 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Rtl1Q7M732 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Rtl1Q7M732 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
Rtl1Q7M732 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Rtl1Q7M732 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Rtl1Q7M732 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Rtl1Q7M732 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Rtl1Q7M732 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Rtl1Q7M732 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Rtl1Q7M732 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Rtl1Q7M732 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Rtl1Q7M732 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms